ניר בנים הוקמה על ידי גרעין בוגרי צבא מבני המושבים ואליו הצטרף גרעין נח"ל של בני המושבים. בחודש נובמבר 1951 עלו הגרעינים להתיישב, באופן זמני, בצור מעון שבין הקיבוצים נירים ומגן (יישוב שלא קיים יותר). לאחר מכן עברו לגת 2 (משבצת שהפכה לאחר מכן למושב עובדים). הגרעינים עבדו את השטח כקומונה ותוך כדי כך נבנה המושב.
בחודש יוני 1955 פורקה הקומונה והחברים קיבלו את משקיהם.
עד שנת 1992 התקיימה בניר בנים שיטת ריכז ההכנסות וההוצאות ומשנת 1993 עוסקת האגודה אך ורק בניהול המשק הציבורי הכולל: אספקת מים, אחזקת דרכי שדות, קשר עם הרשויות האזוריות והארציות ואינה מעורבת בתחומי הייצור הישירים של החבר הבודד. השיווק כולו עצמי.
מוסדות ציבור: ארכיון שבו מוצגים שונים, מסמכים ותמונות מראשית ימי ניר בנים.
אנדרטה לזכר בני הכפר שנפלו במערכות ישראל שלידה נערך, מדי שנה, ביום הזיכרון לחללי ישראל, טכס אזכרה.
בית עם ומועדון שבו מתרכזות פעילויות התרבות של הכפר וכן מועדונים לילדים ולנוער לפעילויותיהם.
בריכת שחיה וסביבה דשא גדול המשמש לאירועים וחגים.
צרכנייה, מגרש ספורט, מרפאה וספרייה פעילה.
חינוך: בכפר פועלים פעוטונים, קיימות פעילויות נוער על ידי רכז נוער ומד"צים.
פעולות תרבות: את חג הכפר מציינים אחת לחמש שנים במסיבה גדולה. בחג השבועות נערך, מדי שנה, טכס הבאת ביכורים, טכס בני מצווה ופרידה מהמתגייסים. 
כמו כן אנו חוגגים את החגים: חנוכה, פורים וט"ו בשבט לכלל הציבור.